MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium acetobutylicum ATCC 824 plasmid pSOL1

Total Repeats: 4811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001988	AGG	2	6	29	34	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001988	AATATA	2	12	50	61	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004706
3	NC_001988	TTA	2	6	65	70	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004706
4	NC_001988	GGATA	2	10	86	95	40 %	20 %	40 %	0 %	15004706
5	NC_001988	A	6	6	126	131	100 %	0 %	0 %	0 %	15004706
6	NC_001988	ATT	3	9	136	144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004706
7	NC_001988	AGA	3	9	148	156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15004706
8	NC_001988	AGA	2	6	165	170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15004706
9	NC_001988	A	6	6	174	179	100 %	0 %	0 %	0 %	15004706
10	NC_001988	TA	3	6	251	256	50 %	50 %	0 %	0 %	15004706
11	NC_001988	ATG	2	6	263	268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004706
12	NC_001988	AAT	2	6	334	339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004706
13	NC_001988	GCTTA	2	10	366	375	20 %	40 %	20 %	20 %	15004706
14	NC_001988	ATC	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15004706
15	NC_001988	ATT	2	6	405	410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004706
16	NC_001988	AGG	2	6	465	470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15004706
17	NC_001988	TA	3	6	495	500	50 %	50 %	0 %	0 %	15004706
18	NC_001988	T	6	6	514	519	0 %	100 %	0 %	0 %	15004706
19	NC_001988	CAG	2	6	596	601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15004706
20	NC_001988	CA	3	6	676	681	50 %	0 %	0 %	50 %	15004706
21	NC_001988	AATTA	2	10	705	714	60 %	40 %	0 %	0 %	15004706
22	NC_001988	TAGA	2	8	743	750	50 %	25 %	25 %	0 %	15004706
23	NC_001988	TA	3	6	822	827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001988	TTA	2	6	870	875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001988	ATT	2	6	899	904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001988	A	7	7	921	927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001988	GAA	2	6	930	935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001988	A	7	7	948	954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001988	ATT	2	6	981	986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001988	T	6	6	1004	1009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001988	A	6	6	1020	1025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001988	ATT	2	6	1032	1037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001988	AAT	2	6	1048	1053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001988	T	6	6	1061	1066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001988	TAT	2	6	1130	1135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001988	TAA	2	6	1139	1144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_001988	TAA	2	6	1162	1167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001988	A	6	6	1166	1171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001988	A	6	6	1184	1189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001988	TTA	2	6	1203	1208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001988	ACGA	2	8	1290	1297	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_001988	T	6	6	1308	1313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001988	TAAA	2	8	1332	1339	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001988	GAA	2	6	1361	1366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15004707
45	NC_001988	TAT	2	6	1408	1413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004707
46	NC_001988	GTA	2	6	1423	1428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004707
47	NC_001988	TAA	2	6	1445	1450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004707
48	NC_001988	GCA	2	6	1452	1457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15004707
49	NC_001988	ATG	2	6	1507	1512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004707
50	NC_001988	ATG	2	6	1645	1650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004707
51	NC_001988	A	7	7	1848	1854	100 %	0 %	0 %	0 %	15004707
52	NC_001988	AGTAT	2	10	1986	1995	40 %	40 %	20 %	0 %	15004707
53	NC_001988	GCA	2	6	2019	2024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15004707
54	NC_001988	AGT	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004707
55	NC_001988	A	6	6	2508	2513	100 %	0 %	0 %	0 %	15004707
56	NC_001988	TAGTT	2	10	2576	2585	20 %	60 %	20 %	0 %	15004707
57	NC_001988	CAA	2	6	2587	2592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15004707
58	NC_001988	CTA	2	6	2608	2613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15004707
59	NC_001988	CTT	2	6	2632	2637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15004707
60	NC_001988	GAT	2	6	2661	2666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004707
61	NC_001988	CTG	2	6	2698	2703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15004707
62	NC_001988	GGA	2	6	2720	2725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15004707
63	NC_001988	ATT	2	6	2751	2756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004707
64	NC_001988	TAG	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004707
65	NC_001988	TAA	2	6	2768	2773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004707
66	NC_001988	ATA	2	6	2820	2825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004707
67	NC_001988	TA	3	6	2871	2876	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
68	NC_001988	AT	3	6	2902	2907	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
69	NC_001988	CATA	2	8	2910	2917	50 %	25 %	0 %	25 %	15004707
70	NC_001988	AGA	2	6	3017	3022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15004707
71	NC_001988	TTAGA	2	10	3076	3085	40 %	40 %	20 %	0 %	15004707
72	NC_001988	ATT	2	6	3094	3099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004707
73	NC_001988	TAC	2	6	3110	3115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15004707
74	NC_001988	GAT	2	6	3120	3125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004707
75	NC_001988	TA	3	6	3128	3133	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
76	NC_001988	TGA	2	6	3137	3142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004707
77	NC_001988	AAAT	2	8	3143	3150	75 %	25 %	0 %	0 %	15004707
78	NC_001988	TAA	2	6	3212	3217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004707
79	NC_001988	ATA	2	6	3259	3264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004707
80	NC_001988	GAT	2	6	3285	3290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004707
81	NC_001988	ATG	3	9	3376	3384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004707
82	NC_001988	ATT	2	6	3393	3398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004707
83	NC_001988	AT	3	6	3414	3419	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
84	NC_001988	TA	3	6	3420	3425	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
85	NC_001988	AT	3	6	3438	3443	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
86	NC_001988	AAAGT	2	10	3463	3472	60 %	20 %	20 %	0 %	15004707
87	NC_001988	TA	5	10	3501	3510	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
88	NC_001988	TAT	2	6	3522	3527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004707
89	NC_001988	ATA	2	6	3577	3582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004707
90	NC_001988	ATA	2	6	3589	3594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004707
91	NC_001988	ATT	2	6	3622	3627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004707
92	NC_001988	ATG	2	6	3634	3639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004707
93	NC_001988	TAT	2	6	3648	3653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004707
94	NC_001988	AATT	2	8	3683	3690	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
95	NC_001988	TA	4	8	3756	3763	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
96	NC_001988	TAA	2	6	3776	3781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004707
97	NC_001988	ATA	2	6	3808	3813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004707
98	NC_001988	AT	4	8	3852	3859	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
99	NC_001988	TA	4	8	3864	3871	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
100	NC_001988	ATG	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004707
101	NC_001988	TA	4	8	3977	3984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_001988	TA	3	6	4012	4017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_001988	TA	3	6	4040	4045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_001988	A	6	6	4076	4081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_001988	GGA	2	6	4096	4101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_001988	GAA	3	9	4109	4117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15004708
107	NC_001988	TAT	2	6	4120	4125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004708
108	NC_001988	GGC	2	6	4167	4172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15004708
109	NC_001988	TAAA	2	8	4621	4628	75 %	25 %	0 %	0 %	15004708
110	NC_001988	GACA	2	8	4651	4658	50 %	0 %	25 %	25 %	15004708
111	NC_001988	CTA	2	6	4693	4698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15004708
112	NC_001988	TCT	2	6	4719	4724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15004708
113	NC_001988	AAT	2	6	4787	4792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004708
114	NC_001988	ACA	2	6	4872	4877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15004708
115	NC_001988	CAG	2	6	4987	4992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15004708
116	NC_001988	TACA	2	8	5003	5010	50 %	25 %	0 %	25 %	15004708
117	NC_001988	AAG	2	6	5253	5258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15004708
118	NC_001988	TAAA	2	8	5281	5288	75 %	25 %	0 %	0 %	15004708
119	NC_001988	CTA	2	6	5353	5358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15004708
120	NC_001988	CTT	2	6	5377	5382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15004708
121	NC_001988	TGG	2	6	5435	5440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15004708
122	NC_001988	CAA	2	6	5458	5463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15004708
123	NC_001988	TTG	2	6	5497	5502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15004708
124	NC_001988	TA	3	6	5616	5621	50 %	50 %	0 %	0 %	15004708
125	NC_001988	TGA	2	6	5672	5677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004708
126	NC_001988	TA	3	6	5678	5683	50 %	50 %	0 %	0 %	15004708
127	NC_001988	GAT	2	6	5747	5752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004708
128	NC_001988	TAG	2	6	5761	5766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004708
129	NC_001988	ATA	2	6	5781	5786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004708
130	NC_001988	CATG	2	8	5805	5812	25 %	25 %	25 %	25 %	15004708
131	NC_001988	GAT	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004708
132	NC_001988	TAC	2	6	5855	5860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15004708
133	NC_001988	GAT	2	6	5865	5870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004708
134	NC_001988	GATAAA	2	12	5958	5969	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15004708
135	NC_001988	ATG	2	6	6109	6114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004708
136	NC_001988	ATTA	2	8	6129	6136	50 %	50 %	0 %	0 %	15004708
137	NC_001988	TTC	2	6	6167	6172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15004708
138	NC_001988	AT	3	6	6174	6179	50 %	50 %	0 %	0 %	15004708
139	NC_001988	TAC	2	6	6261	6266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15004708
140	NC_001988	AGTT	2	8	6295	6302	25 %	50 %	25 %	0 %	15004708
141	NC_001988	TAAAAA	2	12	6317	6328	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15004708
142	NC_001988	CAG	2	6	6350	6355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15004708
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315	NC_001988	T	6	6	12827	12832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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411	NC_001988	GCA	2	6	16565	16570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15004719
412	NC_001988	TGT	2	6	16571	16576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15004719
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